În cadrul clusterelor Eureka se organizează apeluri de proiecte „Eureka-Cluster” conform calendarului stabilit la nivelul consortiului. Evaluarea propunerilor de proiecte depuse în competiție se realizează potrivit procedurilor comunicate în pagina web dedicată fiecărui apel.

Participarea în cadrul clusterelor Eureka este deschisă tuturor statelor membre sau asociate EUREKA indiferent dacă fac sau nu parte din rândul statelor inițiatoare sau care și-au exprimat suportul la constituirea clusterului.

Clusterul Eureka acordă proiectelor selectate o recomandare sub forma unui certificat (label) cu valabilitate limitată, care certifică candidatura în obținerea finanțării naționale din partea țărilor participante. Proiectele ce implică parteneri din România pot beneficia de finanțare la nivel național prin condițiile impuse în Pachetul de informații EUREKA.